| Name | Image | Location | City | Province | Network | Area of study | Summary |
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| Orto Botanico di Brera |  | | Milan | Milan | Network of botanical gardens | Botanical garden | |
| Orto Botanico Didattico e Sperimentale "Cascina Rosa" | | | Milan | Milan | Network of botanical gardens | Botanical garden | |
| Orto Botanico Didattico Sperimentale dell'Università di Milano | | | Milan | Milan | | Botanical garden | |
| Museo boschi Di Stefano [ fr; it; ru ] | | | Milan | Milan | Network of historic house museum | Historic house museum | |
| Villa Necchi Campiglio | | | Milan | Milan | Network of historic house museum | Historic house museum | |
| Museo Bagatti Valsecchi | | | Milan | Milan | Network of historic house museum | Historic house museum | |
| Museo Poldi Pezzoli |  | | Milan | Milan | Network of historic house museum | Historic house museum | |
| Convento Santa Maria delle Grazie (The Last Supper) | | | Milan | Milan | | Art | |
| Gallerie di Piazza Scala | | | Milan | Milan | | Art | |
| Milan Cathedral Museum | | | Milan | Milan | | Art | |
| Modern Art Gallery | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo del Novecento | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo d'Arte Paolo Pini (MAPP) | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo Diocesano | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo della Permanente | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo di Sant'Eustorgio | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo Villa Clerici | | | Milan | Milan | | Art | |
| Padiglione d'Arte Contemporanea (PAC) | | | Milan | Milan | | Art | |
| Pinacoteca Ambrosiana | | | Milan | Milan | | Art | |
| Pinacoteca di Brera | | | Milan | Milan | | Art | |
| Royal Palace of Milan | | | Milan | Milan | | Art | |
| Triennale Museum | | | Milan | Milan | | Art and design | |
| Archaeological Museum | | | Milan | Milan | | History | |
| Museum del Risorgimento | | | Milan | Milan | | History | |
| Civic Aquarium of Milan | | | Milan | Milan | | Natural history | |
| Natural History Museum of Milan | | | Milan | Milan | | Natural history | |
| Museo Nazionale Scienza e Tecnologia Leonardo da Vinci |  | | Milan | Milan | | Science | |
| Planetarium of Milan | | | Milan | Milan | | Science | |
| Achille Bertarelli Prints Collection | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | Art | The Milan collection of old prints. |
| Antique Furniture & Wooden Sculpture Museum | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| Applied Arts Collection | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| Egyptian Museum | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| Museum of Musical Instruments | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| The Museum of Ancient Art | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| The Prehistoric collections of the Archaeological Museum of Milan. | | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | | |
| Sforza Castle Pinacoteca |  | | Milan | Milan | Raccolte civiche Castello Sforzesco Sforza Castle | Art | |
| Museo storico Alfa Romeo | | | Arese | Milan | | | |
| Monumental Cemetery of Milan | | | Milan | Milan | | Art | |
| Museo Teatrale alla Scala | | | Milan | Milan | | | |
| San Siro Museum (AC Milan and FC Internazionale Museum) | | | Milan | Milan | | | |
| Museo Miscellaneo Galbiati | | | Brugherio | Milan | | | |
| Museo Civico dei Mestieri e della Memoria | | | Casorezzo | Milan | | Ethnography | |
| Museo Storico | | | Castano Primo | Milan | | History | |
| Museo Civico di Cernusco sul Naviglio | | | Cernusco sul Naviglio | Milan | | | |
| Museo di fotografia contemporanea [ it ] | | | Cinisello Balsamo | Milan | Museum recognized | | |
| Collezione Privata "Carlo Alberto Pisani Dossi" | | | Corbetta | Milan | | | |
| Museo del legno Luigi Magugliani [ it ] | | | Corbetta | Milan | | | |
| Museo delle Comunicazioni | | | Cormano | Milan | | | |
| Museo Storico Civico Cuggionese | | | Cuggiono | Milan | | | |
| Mostra permanente della vita contadina e delle fornaci | | | Garbagnate Milanese | Milan | | Ethnography | |
| Museo Civico il Ninfeo di Lainate | | | Lainate | Milan | Collection recognized | | |
| Museo civico Guido Sutermeister [ it ] | | | Legnano | Milan | Collection recognized | | |
| Museo Civico "Don Cesare Amelli" | | | Melegnano | Milan | | | |
| Fondazione Emilio Carlo Mangini - Museo Mangini Bonomi | | | Milano | Milan | Collection recognized | | |
| Galleria d'Arte Sacra dei Contemporanei | | | Milano | Milan | Collection recognized | | |
| Museo della Basilica di Santa Maria della Passione | | | Milano | Milan | | | |
| Museo dei Beni Culturali Cappuccini | | | Milano | Milan | Museum recognized | | |
| Museo Louis Braille | | | Milano | Milan | Collection recognized | | |
| Museo del Cinema | | | Milano | Milan | | | |
| Museo della Fondazione Arnaldo Pomodoro | | | Milano | Milan | | | |
| Museo della Fondazione Luciano Minguzzi | | | Milano | Milan | | | |
| Civico museo-studio Francesco Messina [ it ] | | | Milan | Milan | Museum recognized | | |
| Palazzo Morando [ it ] - Museo del Costume Moda e Immagine | | | Milan | Milan | Museum recognized | | |
| Museo Martinitt e Stelline | | | Milan | Milan | Museum recognized | | |
| Museo Nazionale Casa del Manzoni | | | Milan | Milan | | | |
| Museo Regionale della Psichiatria | | | Milan | Milan | Collection recognized | | |
| Museo Popoli e Culture | | | Milan | Milan | Museum recognized | | |
| Museo Sezione Mineralogia Dipartimento Scienze della Terra | | | Milan | Milan | | | |
| Quadreria dei Benefattori dell'Ospedale Maggiore di Milano | | | Milan | Milan | | | |
| Grande Museo del Duomo di Milano [ it ] | | | Milan | Milan | | | |
| Zucchi Collection Museum | | | Milan | Milan | | | |
| Museo dell'Abbazia di Morimondo | | | Morimondo | Milan | Museum recognized | | |
| Museo Civico "Angelo Comolli" | | | Morimondo | Milan | | | |
| Museo Kartell | | | Noviglio | Milan | | | |
| Museo Storico del Combattente | | | Paderno Dugnano | Milan | | | |
| Museo Archeologico Storico Culturale Carla Musazzi | | | Parabiago | Milan | | | |
| Museo Zucchi Collection | | | Rescaldina | Milan | | | |
| Museo Rolf Schalling Le pentole nella Storia | | | Rozzano | Milan | | | |
| Museo della Villa San Carlo Borromeo | | | Senago | Milan | | | |
| Ecomuseo Adda di Leonardo | | | Parco Adda Nord | Milan | Ecomuseum recognized by the Lombardy Region | Ecomuseum | |
| Ecomuseo Urbano Metropolitano di Milano Nord (EUMM) | | | Milan | Milan | Ecomuseum recognized by the Lombardy Region | Ecomuseum | |
| Ecomuseo del paesaggio di Parabiago [ it ] | | | Parabiago | Milan | Ecomuseum recognized by the Lombardy Region | Ecomuseum | |
