Nocardioides

Nocardioides
Scientific classification
Domain:	Bacteria
Kingdom:	Bacillati
Phylum:	Actinomycetota
Class:	Actinomycetia
Order:	Propionibacteriales
Family:	Nocardioidaceae
Genus:	Nocardioides Prauser 1976 (Approved Lists 1980)Species [1]
Type species
Nocardioides albus Prauser 1976 (Approved Lists 1980) [2] [3]
Species [4]
See text
Synonyms [5]
PimelobacterSuzuki and Komagata 1983

Nocardioides is a Gram-positive, mesophilic and aerobic bacterial genus from the family of Nocardioidaceae. ^{[1] [6]}

Phylogeny

The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) ^[1] and National Center for Biotechnology Information (NCBI). ^[4]

16S rRNA based LTP_10_2024 [7] [8] [9]

120 marker proteins based GTDB 09-RS220 [10] [11] [12]

Nocardioides~ Nocardioides pakistanensis Amin et al. 2016 Nocardioides speluncaeFang et al. 2019 Nocardioides guangzhouensisChen et al. 2020 Nocardioides iriomotensis Yamamura et al. 2011 Nocardioides panacisPark et al. 2022 Nocardioides~ Nocardioides echinoideorum Lin et al. 2015 Nocardioides pacificus Fan et al. 2014 Marmoricola Nocardioides N. massiliensis Dubourg et al. 2016 N. mesophilus Dastager et al. 2010 "N. jiangsuensis" Wang et al. 2023 N. donggukensisKim et al. 2021 N. cavernaquaeZhu et al. 2022 N. phosphati Xie et al. 2017 N. daedukensis Yoon et al. 2010 N. jensenii(Suzuki and Komagata 1983) Collins et al. 1989 N. daejeonensis Woo et al. 2012 N. alcanivoransMitzscherling et al. 2022 N. dubius Yoon et al. 2005 N. campestrisoliZhou et al. 2022 N. gilvus Zhang et al. 2017 N. houyundeiiWang et al. 2018 N. ochotonaeZhou et al. 2022 N. solisilvae Sultanpuram, Mothe & Mohammed 2015 N. jishuliiDong et al. 2020 N. malaquaeZhang et al. 2021 N. daphniae Tóth et al. 2008 N. perillae Du et al. 2013 N. yefusuniiHuang et al. 2019 N. alkalitolerans Yoon et al. 2005 N. zeae Glaeser et al. 2014 N. dilutus corrig. Dastager et al. 2009 N. halotolerans Dastager et al. 2009 N. anomalusPark et al. 2020 N. flavescensZhang et al. 2020 N. aquaticus Lawson et al. 2000 N. dongkuiiCheng et al. 2021 N. pantholopisZhou et al. 2022 N. dokdonensis Park et al. 2008 N. marmotaeZhang et al. 2023 N. lianchengensis Zhang, Ma & Yu 2012 N. cremeusWang et al. 2023 N. marinisabuli Lee, Hyun &Lee 2007 N. salarius Kim et al. 2008 N. sediminis Dastager et al. 2009 N. terrigena Yoon et al. 2007 N. ferulaeLiu et al. 2019' N. kribbensis Yoon et al. 2005 N. oceaniWang et al. 2023 N. lijunqiniaeCheng et al. 2021 N. psychrotolerans Liu et al. 2013 N. szechwanensis Liu et al. 2013 N. intraradicalis Huang et al. 2016 N. caricicola Song et al. 2011 N. salsibiostraticola Cho et al. 2013 N. fonticola Chou et al. 2008 N. abyssiWang et al. 2023 N. deserti Tuo et al. 2015 N. aquiterrae Yoon et al. 2004 N. hungaricus Tóth et al. 2011 N. pyridinolyticus Yoon et al. 1997 N. soli Sun et al. 2014 non Srinivasan et al. 2014 N. hankookensis Yoon et al. 2008 N. conyzicola Han et al. 2013 N. endophyticus Han et al. 2013 N. panaciterrulaeKim et al. 2019 N. lutiYoon et al. 2022 N. koreensis Dastager et al. 2008 N. ginsengisegetis Im et al. 2011 N. ungokensisZhao et al. 2015 N. acrostichiChen et al. 2021 N. baekrokdamisoli N. nematodiphilusZhang et al. 2022 N. terrae Zhang, Liu & Liu 2009 N. opuntiae Lee and Seong 2014 N. panacihumi An et al. 2007 N. agrisoliWang et al. 2017 N. mangroviChen et al. 2022 N. ginkgobilobae Xu et al. 2016 N. marinus Choi et al. 2007 N. albertanoniae Alias-Villegas et al. 2013 N. luteus Prauser 1985 N. albusPrauser 1976 N. panzhihuensis corrig. Qin et al. 2012 N. currusPark et al. 2018 N. allogilvusZhang et al. 2018 N. piscisHyun et al. 2022 N. seonyuensisRoh et al. 2020 N. baculatusChhetri et al. 2021 N. potassiiLiu et al. 2023 N. glacieisoliLiu et al. 2015 N. zhouiiZhang et al. 2019 N. piniSo et al. 2023 N. cavernae Han et al. 2017 N. flavusWang, Zhou & Zhang 2016 non Singh & Yin 2016 non Ruan & Zhang 1979 N. zeicaulis Kämpfer et al. 2016 N. pinisoliSo et al. 2023 N. hwasunensis Lee, Lee & Kim 2008 N. exalbidus Li, Xie & Yokota 2007 N. ganghwensis Yi and Chun 2004 N. oleivorans Schippers, Schumann & Sproer 2005 N. palaemonisKim et al. 2022 N. eburneiflavusRoh et al. 2020 N. okcheonensisKim, Ham & Kim 2023 N. alpinus Zhang et al. 2012 N. furvisabuli Lee 2007 N. lacusdianchiiXiao et al. 2023 N. gansuensisWu et al. 2019 N. insulae Yoon et al. 2007 N. aestuarii Yi and Chun 2004 N. euryhaloduransRoh et al. 2020 N. kandeliaeLiu et al. 2017 N. sonneratiaeLi et al. 2017 N. coralliShi et al. 2022 N. rotundus Wang, Li & Zhang 2016 N. taihuensisQu et al. 2017 N. bigeumensis Dastager et al. 2008 N. lentus Yoon et al. 2006 N. nanhaiensisZhang et al. 2014 N. ginsengagri Lee et al. 2012 N. antarcticus Deng et al. 2015 N. marinquilinus Cho et al. 2013 N. dongxiaopingiiZhang et al. 2020 N. litoris Lee et al. 2017 N. plantarum Collins, Cockcroft & Wallbanks 1994 N. rubriscoriae corrig. Lee and Lee 2014 N. cynanchiSuh et al. 2021 N. agariphilus Dastager et al. 2008 N. islandensis corrig. Dastager et al. 2009 N. tritolerans Dastager et al. 2009 N. sambongensisHwang et al. 2020 N. humi Kim et al. 2009 N. daecheongensis Lim et al. 2014 N. maradonensis Lee et al. 2011 N. ultimimeridianus Lee et al. 2011 N. humilatusLee et al. 2022 N. stalactitiZhou et al. 2021 N. immobilisLu et al. 2017 N. pelophilusYan et al. 2018 N. silvaticusLi et al. 2019 N. panacisoli Cho et al. 2010 N. litorisoli Wang et al. 2017 N. thalensisKhan et al. 2017 N. vastitatisLiu et al. 2020 N. montaniterrae Srinivasan et al. 2015 N. faecalisZhang et al. 2023 N. daeguensis Cui et al. 2013 N. kongjuensis Yoon et al. 2006 N. caeni Yoon et al. 2009 N. albidus Singh et al. 2016 N. convexusPark et al. 2020 N. nitrophenolicus Yoon et al. 1999 N. ginsengisoli Cui et al. 2009 N. aromaticivorans Kubota et al. 2005 N. simplex(Jensen 1934) O'Donnell, Goodfellow & Minnikin 1983

Marmoricola caldifontis "Nocardioides jiangsuensis" Nocardioides_B Nocardioides panacis Nocardioides iriomotensis Nocardioides mesophilus Nocardioides massiliensis Marmoricola Nocardioides N. perillae N. alkalitolerans N. zeae N. speluncae N. cavernaquae "N. jejuensis" Jang et al. 2020 N. phosphati N. donggukensis N. guangzhouensis N. daedukensis N. jensenii N. alcanivorans N. daejeonensis N. houyundeii N. campestrisoli N. solisilvae N. gilvus N. yefusunii N. malaquae N. daphniae N. jishulii N. sediminis N. terrigena N. piscis N. allogilvus N. currus N. gansuensis N. seonyuensis N. furvisabuli N. lacusdianchii "N. astragali" Xu et al. 2018 N. alpinus N. zhouii N. glacieisoli N. baculatus N. potassii N. okcheonensis N. palaemonis N. hwasunensis N. exalbidus N. oleivorans N. cavernae N. flavus N. eburneiflavus N. ganghwensis N. rotundus N. coralli N. euryhalodurans N. cynanchi N. agariphilus N. islandensis N. aquaticus N. flavescens N. anomalus N. halotolerans N. dongxiaopingii N. litoris N. plantarum N. rubriscoriae N. kribbensis N. ferulaeLiu et al. 2019 N. dongkuii N. lianchengensis N. ochotonae N. pantholopis N. deserti N. marmotae N. psychrotolerans N. lijunqiniae N. szechwanensis N. mangrovi N. soli N. panaciterrulae N. ungokensis N. ginsengisegetis N. luti N. marinus N. acrostichi "N. bruguierae" Chen et al. 2023 N. dokdonensis N. marinisabuli N. salarius N. insulae N. terrae N. baekrokdamisoli Lee et al. 2016 N. nematodiphilus N. albertanoniae N. luteus N. albus N. panzhihuensis N. panacisoli N. thalensis N. pelophilus N. humilatus N. stalactiti N. silvaticus "N. antri" Lee et al. 2021 N. immobilis N. sambongensis N. faecalis N. caeni N. aromaticivorans N. simplex "N. carbamazepini" Benedek et al. 2022 N. albidus N. humi N. nitrophenolicus N. daeguensis N. kongjuensis

Unassigned species:

• "Ca. N. delftensis" Rubio-Rincón et al. 2019
• "N. flava" Singh and Yin 2016 non Ruan & Zhang 1979 non Wang, Zhou & Zhang 2016
• "N. ginsengiglaebae" Yoon, Ten & Im 2007b
• "N. imazamoxiresistens" Wang et al. 2024
• "N. jiangxiensis" Wan et al. 2024
• "N. limicola" Zhu et al. 2024
• N. lutiYoon et al. 2022
• "N. maritimus" Lee & Lee 2008
• "N. paucivorans" Ahn et al. 2014
• "N. suum" Lee et al. 2017
• "N. terrisoli" Lee, Chaudhary & Kim 2024
• "N. turkmenicus" Saygin et al. 2024
• "N. xinjiangensis" Mo et al. 2024

See also

• List of bacterial orders
• List of bacteria genera

References

1. A.C. Parte; et al. "Nocardioides". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2025-02-28.
2. Prauser H. (1976). "Nocardioides, a new genus of the order Actinomycetales". International Journal of Systematic Bacteriology. 26: 58–65. doi: 10.1099/00207713-26-1-58 .
3. Skerman VB, McGowan V, Sneath PH (1980). "Approved lists of bacterial names". Int J Syst Bacteriol. 30: 225–420. doi: 10.1099/00207713-30-1-225 .
4. C.L. Schoch; et al. "Nocardioides". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2025-02-28.
5. O'Donnell AG, Goodfellow M, Minnikin DE (1982). "Lipids in the classification of Nocardioides: Reclassification of Arthrobacter simplex (Jensen) Lochhead in the genus Nocardioides (Prauser) emend. O'Donnell et al. as Nocardioides simplex comb. nov". Arch Microbiol. 133: 323–329. doi:10.1007/bf00521299. PMID   7171289.
6. Yoon, Jung-Hoon; Park, Yong-Ha (1 January 2006). "The Genus Nocardioides". The Prokaryotes. Springer New York: 1099–1113. doi:10.1007/0-387-30743-5_44.
7. "The LTP" . Retrieved 10 December 2024.
8. "LTP_all tree in newick format" . Retrieved 10 December 2024.
9. "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF). Retrieved 10 December 2024.
10. "GTDB release 09-RS220". Genome Taxonomy Database . Retrieved 10 May 2024.
11. "bac120_r220.sp_labels". Genome Taxonomy Database . Retrieved 10 May 2024.
12. "Taxon History". Genome Taxonomy Database . Retrieved 10 May 2024.

Further reading

• Patel, Ramesh N., ed. (2007). Biocatalysis in the pharmaceutical and biotechnology industries. Boca Raton: CRC Press. ISBN   1-4200-1937-6.
• Patel, Ramesh N., ed. (2000). Stereoselective biocatalysis. New York, NY [u.a.]: Dekker. ISBN   0-8247-8282-8.