This article lists the genera of the Archaea and also shows taxa of archaea that do not contain genera. The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1] and National Center for Biotechnology Information (NCBI) [2] unless otherwise noted.
For the GTDB phylogeny, National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy was initially used to decorate the genome tree via tax2tree. The 16S rRNA-based Greengenes taxonomy is used to supplement the taxonomy particularly in regions of the tree with no cultured representatives. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) is used as the primary taxonomic authority for establishing naming priorities. Taxonomic ranks are normalised using Phylorank and the taxonomy manually curated to remove polyphyletic groups. [3] [4] [5] [6] [7]
Cladogram was taken from the GTDB release 10-RS226 (16 April 2025). [8] [9] [10]
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| Phylogeny of "Micrarchaeota" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Nanohalobiales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Nanobdellota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Order "Pacearchaeales"
Order "Woesearchaeales"
Taxonomy of this group is based on LPSN, [1] and also these works: [11] [12] [13] [14]
| Phylogeny of "Asgardarchaeota" [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Promethearchaeales" [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoproteota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Hecatellales" [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Houtuarculales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Wuzhiqiibiales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Bathyarchaeales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Caldarchaeales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Nitrososphaerales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoproteales [8] [9] [10] | |||||||||
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| Phylogeny of Sulfolobales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermococci [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanobacteriota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoplasmatota [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanomassiliicoccales [8] [9] [10] | |||||||||||||||
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| Phylogeny of "Halarchaeoplasmatales" [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoplasmatales [8] [9] [10] |
| Phylogeny of Halobacteriota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Archaeoglobia" [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanocellales [8] [9] [10] | |||
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Family Methermicoccaceae Cheng et al. 2007
| Phylogeny of Methanosarcinales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanomicrobiales [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Halobacteriales [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Natrialbaceae [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||
| Phylogeny of Haloferacaceae [8] [9] [10] |