This article lists the genera of the Archaea. The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1] and National Center for Biotechnology Information (NCBI). [2] However, in the List provided below, GTDB has precedence unless otherwise noted.
National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy was initially used to decorate the genome tree via tax2tree. The 16S rRNA-based Greengenes taxonomy is used to supplement the taxonomy particularly in regions of the tree with no cultured representatives. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) is used as the primary taxonomic authority for establishing naming priorities. Taxonomic ranks are normalised using phylorank and the taxonomy manually curated to remove polyphyletic groups. [3] [4] [5] [6] [7]
Cladogram was taken from the GTDB release 10-RS226 (16th April 2025). [8] [9] [10] The position of clades with a "question mark" are based on the additional phylogeny of the 16S rRNA-based LTP_12_2021 by The All-Species Living Tree Project. [11] [12] [13]
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| Phylogeny of Micrarchaeota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Nanohalobiales [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Nanobdellota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Promethearchaeota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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In GTDB as order CR-4
| Phylogeny of Promethearchaeales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoproteota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Hecatellaceae" [8] [9] [10] | |||||||||||||||
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| Phylogeny of Houtuarculales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Wuzhiqiibiales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Bathyarchaeales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Caldarchaeales" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Nitrososphaerales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoproteales [8] [9] [10] | |||||||||
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| Phylogeny of Sulfolobales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanobacteriota_B [8] [9] [10] | ||||||||||||
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| Phylogeny of Methanobacteriota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoplasmatota [8] [9] [10] | ||||||||||||
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| Phylogeny of Methanomassiliicoccales [8] [9] [10] | |||||||||||||||
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| Phylogeny of Halarchaeoplasmatales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Thermoplasmatales [8] [9] [10] |
| Phylogeny of Halobacteriota [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of "Archaeoglobia" [8] [9] [10] | ||||||||||||
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| Phylogeny of "Syntropharchaeia" [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanocellales [8] [9] [10] | |||
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| Phylogeny of Methanosarcinales [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Methanomicrobiales [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Halobacteriales [8] [9] [10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Phylogeny of Natrialbaceae [8] [9] [10] | |||||||||||||||||||||||||||
| Phylogeny of Haloferacaceae [8] [9] [10] |